怎么判断征地补偿协议是否有效

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要视具体情况而定。只要不违背相关禁止性条款，满足合同订立额的条件，就有效。征地补偿协议满足以下条件就有效：
(一)行为人具有相应的民事行为能力；
(二)意思表示真实；
(三)不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。