自然人股東的股權轉讓公司繳税嗎

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要，雙方就轉讓金額分別繳納0.05%的印花税；如果是溢價轉讓，轉讓方以股權轉讓收入減除股權原值和合理費用後的餘額為應納税所得額，按“財產轉讓所得”繳納個人所得税。
《中華人民共和國公司法》第一百三十七條
《中華人民共和國公司法》第一百四十一條