雙方同意後直接在合同上修改條款 - 修改部分有效嗎

合同經過雙方同意進行修改能生效。修改合同的經過雙方協商一致同意後，需要重新簽訂合同或在原合同相應條款作修改或補充，並在修改地方加蓋雙方公章。
【法律依據】
《民法典》第五百四十三條，當事人協商一致，可以變更合同。