中標後甲方還能質疑嗎

可以質疑。中標候選人公示期內，投標人或其他利害關係人如對中標候選人或評標有異議，可以向招標人或招標代理機構提出。招標人在收到異議之日起三日內做出答覆。招標人和中標人應當自中標通知書發出之日起三十日內，按照招標文件和中標人的投標文件訂立書面合同。
法律依據：
《招標投標法》第四十六條
招標人和中標人應當自中標通知書發出之日起三十日內，按照招標文件和中標人的投標文件訂立書面合同。招標人和中標人不得再行訂立背離合同實質性內容的其他協議。招標文件要求中標人提交履約保證金的，中標人應當提交。