協議一份合法嗎

合法。合同份數由雙方約定。但是不持有原件的一方會承擔一定的法律風險。
法律依據：
《最高人民法院關於民事訴訟證據的若干規定》第六十九條：下列證據不能單獨作為認定案件事實的依據：無法與原件、原物核對的複製件或者複製品。
也就是説，沒拿原件的人，發生糾紛後會出現舉證困難的情況。