行政公益訴訟的被告是行政機關嗎

是。
1、公民、法人或其他組織直接向人民法院提起訴訟的，作出具體行政行為的行政機關是被告;
2、經複議的案件，複議機關決定維持原具體行政行為，作出原具體行政行為的行政機關是被告;複議機關改變原具體行政行為的，複議機關是被告;
3、兩個以上行政機關作出同一具體行政行為的，共同作出具體行政行為的行政機關是共同被告;
4、由法律、法規授權的組織所作的具體行政行為，該組織是被告。由行政機關委託的組織;
5、所作的具體行政行為，委託的行政機關是被告;
6、行政機關被撤銷的，繼續行使職權的行政機關是被告。
《行政訴訟法》第二十六條